Инструменты биоинформатической разработки
Для кого:
Бакалавры естественнонаучных факультетов
Формат обучения:
Курс
Направление:
Биология
Форма обучения:
Смешанная (очно-заочная)
Продолжительность:
72 а. ч.
Дата начала обучения:
01.09.2025
Форма итоговой аттестации:
Экзамен
Документ об образовании:
Сертификат
Срок действия документа об образовании:
Бессрочно
О дисциплине
Содержание дисциплины охватывает основные инструменты, которые используются в ходе разработки биоинформатического программного обеспечения. Студенты получают практические навыки работы с необходимым набором прикладных программ. В ходе освоения дисциплины студенты знакомятся с операционной системой Linux и основными командами для навигации, создания, удаления и копирования файлов, анализа и модификации файлов (nano, grep, cut, sort, sed). Будет освоено написание скриптов на bash, в том числе для работы с биоинформатическими файлами. Будут затронуты принципы организации процесса вычислений на суперкомпьютерных кластерах, в том числе при помощи планировщика задач Slurm. Будут рассмотрены подходы к установке и запуску программ при помощи пакетного менеджера conda, удаленного репозитория GitHub и контейнеров Docker, Singularity. Студенты освоят основы написание пайплайнов на языке Nextflow и создадут пайплайн для обработки биоинформатических данных с использованием Slurm, Conda и Singularity.
Конфигурации дисциплины
Дисциплина подойдёт вам, если вы
01
Являетесь выпускником бакалавриата и специалитета различных специальностей
02
Желаете получить знания в области биоинформатического анализа данных
03
Планируете работать в области молекулярной биологии и биоинформатического анализа данных
Структура образовательного продукта
Что вас ждет по итогам обучения
- Обучитесь основным инструментам биоинформатической разработки
- Будете уметь работать в Linux, писать и комментировать код
- Будете уметь работать в Linux, писать и комментировать код
- Овладеете биоинформатическими инструментами для разработки диагностических систем
- Узнаете принципы выбора диагностических маркеров методами биоинформатического анализа
- Узнаете принципы выбора диагностических маркеров методами биоинформатического анализа
Научитесь использовать базы данных для выбора объектов биоинформатического анализа
Овладеете языком программирования Python
Список необходимых документов для прохождения дисциплины
- Копия паспорта (разворот + прописка);
- Копия СНИЛС;
- Копия диплома о высшем/среднем профессиональном образовании или справка об обучении;
- Копия документа, подтверждающего трудоустройство обучающегося (копия трудового договора/трудовой книжки/выписка из трудовой книжки) - при наличии;
- Копия документа, подтверждающего инженерную квалификацию (удостоверение/свидетельство/диплом, выписка из трудовой книжки/трудовой договор с указанием должности и выполняемых трудовых функций) – при наличии;
- Заявление/согласие на обработку персональных данных.
Подать заявку на обучение
Налоговый вычет
Как оформить социальный налоговый вычет на обучение
Налоговый вычет за обучение могут получить налоговые резиденты РФ, которые работают в России и платят НДФЛ по ставке 13%
Налоговый вычет — это сумма, которая вычитается из общего дохода, облагаемого налогом (НДФЛ), и именно с этой суммы можно вернуть 13%.
Получить вычет можно за свое обучение или обучение своих детей, подопечных, братьев или сестёр. Оплата за супруга не дает права на вычет, хотя при лечении в этом случае налог возвращают
Оформить вычет за текущий год можно у работодателя, а за предыдущие годы — в налоговой инспекции, подав декларацию 3-НДФЛ
Сведения об образовательной организации
Полное наименование:
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»
Сокращенное наименование:
Новосибирский государственный университет, НГУ
Лицензия на осуществление образовательной деятельности
Регистрационный номер лицензии
№ Л035-00115-54/00096949
Контакты
г. Новосибирск, Академгородок, ул. Пирогова, 2, уч.-лаб. корпус, каб. 402