Геномная биоинформатика
Для кого:
Бакалавры естественнонаучных факультетов
Формат обучения:
Курс
Направление:
Биология
Форма обучения:
Смешанная (очно-заочная)
Продолжительность:
72 а. ч.
Дата начала обучения:
01.09.2025
Форма итоговой аттестации:
Экзамен
Документ об образовании:
Сертификат
Срок действия документа об образовании:
Бессрочно
О дисциплине
Содержание дисциплины охватывает основные этапы анализа геномных данных от фильтрации и оценки качества прочтений до получения аннотированных герминальных и соматических мутаций. В ходе освоения дисциплины студенты знакомятся с основными этапами обработки геномных данных. Будут рассмотрены подходы к оценке качества прочтений, фильтрации и тримминга. Студенты ознакомятся с методами картирования прочтений на референсный геном. Затем будут подробно изучены различные метрики качества картирования, полученные при помощи программ Picard и Mosdepth. Студентами будет изучена и выполнена рекалибровка качества прочтений (BQSR) при помощи программы GATK4. Будут подробно изучены подходы к поиску герминальных и соматических однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и коротких инсерций и делеций (InDel). Также, будут изучены подходы к поиску вариантов числа копий (CNV) в данных геномного секвенирования. Также, будет выполнена подробная аннотация найденных вариантов и будет выполнено сравнение найденных вариантов с эталонными значениями.
Конфигурации дисциплины
Дисциплина подойдёт вам, если вы
01
Являетесь выпускником бакалавриата и специалитета различных специальностей
02
Желаете получить знания в области анализа данных секвенирования
03
Планируете работать с данными NGS
Структура образовательного продукта
Что вас ждет по итогам обучения
Обучитесь основным инструментам анализа данных секвенирования
Научитесь искать мутации с использованием инструментов биоинформатического анализа
Овладеете инструментами для анализа данных секвенирования и узнаете особенности работы с данными NGS
Научитесь отбирать генетические маркеры для создания библиотек секвенирования NGS и овладеете основами математической статистики для обработки первичных результатов
Список необходимых документов для прохождения дисциплины
- Копия паспорта (разворот + прописка);
- Копия СНИЛС;
- Копия диплома о высшем/среднем профессиональном образовании или справка об обучении;
- Копия документа, подтверждающего трудоустройство обучающегося (копия трудового договора/трудовой книжки/выписка из трудовой книжки) - при наличии;
- Копия документа, подтверждающего инженерную квалификацию (удостоверение/свидетельство/диплом, выписка из трудовой книжки/трудовой договор с указанием должности и выполняемых трудовых функций) – при наличии;
- Заявление/согласие на обработку персональных данных.
Подать заявку на обучение
Налоговый вычет
Как оформить социальный налоговый вычет на обучение
Налоговый вычет за обучение могут получить налоговые резиденты РФ, которые работают в России и платят НДФЛ по ставке 13%
Налоговый вычет — это сумма, которая вычитается из общего дохода, облагаемого налогом (НДФЛ), и именно с этой суммы можно вернуть 13%.
Получить вычет можно за свое обучение или обучение своих детей, подопечных, братьев или сестёр. Оплата за супруга не дает права на вычет, хотя при лечении в этом случае налог возвращают
Оформить вычет за текущий год можно у работодателя, а за предыдущие годы — в налоговой инспекции, подав декларацию 3-НДФЛ
Сведения об образовательной организации
Полное наименование:
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»
Сокращенное наименование:
Новосибирский государственный университет, НГУ
Лицензия на осуществление образовательной деятельности
Регистрационный номер лицензии
№ Л035-00115-54/00096949
Контакты
г. Новосибирск, Академгородок, ул. Пирогова, 2, уч.-лаб. корпус, каб. 402